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Zeit für ein Pop-Quiz: Was sind wissenschaftliche Linux-Distributionen?
Die Antwort liegt auf der Hand: Während die meisten Linux-Distributionen Allzweck-Distributionen sind, werden einige spezialisierte mit bestimmten Arten von Software gebündelt. Zum Beispiel gibt es Media-Center-Distributionen, die Ihren Computer in ein Multimedia-Produktionsstudio verwandeln, und sogar einige religiöse Distributionen. In diesem Wissen sollte es Sie nicht überraschen, dass es wissenschaftliche Linux-Distributionen gibt. Schließlich begann die Geschichte von Linux in Forschungslabors, und heute treibt Linux die Server und Workstations der größten Forschungsorganisationen der Welt an.
Einfach ausgedrückt bieten wissenschaftliche Distributionen vorinstallierte Software für verschiedene Forschungszwecke an. Natürlich können Sie Ihr normales Ubuntu in eine wissenschaftliche Distribution verwandeln, indem Sie dieselben Apps installieren, aber der Sinn solcher Distributionen besteht darin, die Jagd nach einzelnen Anwendungen zu vermeiden. Stattdessen bieten sie eine schnelle Möglichkeit, Linux in Forschungseinrichtungen, Bildungseinrichtungen und auf PCs von Studenten und wissenschaftsinteressierten Benutzern einzusetzen. Wenn Sie zu den letzteren gehören, sind hier fünf großartige wissenschaftliche Distributionen, die Sie in Betracht ziehen sollten.
1. Bio-Linux
Diese grün gefärbte Distribution richtet sich an Wissenschaftler, die in der Bioinformatik arbeiten – einem interdisziplinären Feld, das Molekularbiologie und Genetik mit Statistik- und Analysemethoden aus der Informatik verbindet. Bio-Linux wurde am Environmental Omics Synthesis Centre in Großbritannien entwickelt und wird vom Centre for Ecology & Hydrology (CEH) und dem Natural Environment Research Council (NERC) unterstützt und finanziert.
Es ist eine Ubuntu-basierte Distribution, die nur für 64-Bit-Systeme verfügbar ist und zwei Desktop-Umgebungen bietet: Unity als Standard und MATE als leichte Alternative. Die neueste Version (8.0.5) garantiert dank ihres Ubuntu 14.04-Kerns einen langfristigen Support. Bio-Linux 8 enthält buchstäblich Hunderte von Bioinformatik-Tools, sowohl über die Befehlszeile als auch grafisch. Um Ihnen den Einstieg zu erleichtern, bietet Bio-Linux eine PDF-Anleitung .
Software-Highlights: Artemis, eine App zum Betrachten von DNA-Sequenzen und Anmerkungen; Galaxy, eine browserbasierte biomedizinische Forschungsplattform; Fasta, zum Durchsuchen von DNA- und Proteindatenbanken; Mesquite, für Evolutionsbiologie; njplot zum Zeichnen phylogenetischer Bäume und Rasmol zum Visualisieren von Makromolekülen. Wenn Sie Pakete von Bio-Linux auf Ihrem Ubuntu-basierten System installieren möchten, können Sie einfach ihre Repositorys hinzufügen .
Bio-Linux ist kostenlos erhältlich als Live-Image und als OVA-Datei, falls Sie es in VirtualBox ausführen möchten.
Alternative: BioSLAX, eine auf Slackware basierende wissenschaftliche Distribution mit Schwerpunkt auf Bioinformatik und entwickelt an der National University of Singapore.
2. Poseidon-Linux
Wie Bio-Linux hat auch Poseidon Linux ein Farbschema: sanfte Blautöne, die seinem marinen Namen entsprechen. Das Branding wurde von Ozeanologen inspiriert, die an dem Projekt arbeiten, aber Poseidon Linux ist nicht nur für einen Wissenschaftszweig gedacht. Stattdessen bietet es eine breite Palette von Werkzeugen, von 2D- und 3D-Visualisierung, Genetik und Programmier-Apps bis hin zur Unterstützung für Statistik, numerische Modellierung und Kartierung.
Poseidon Linux ist das Ergebnis einer transatlantischen Kooperation zwischen der Bundesuniversität Rio Grande in Brasilien und dem MARUM-Institut in Deutschland. Die aktuelle stabile Version (4.0) hinkt der Zeit hinterher, da sie auf Ubuntu 10.04 basiert. Poseidon 5.0 befindet sich jedoch in der Entwicklung und verspricht langfristige Unterstützung (unterstützt auf Ubuntu 12.04) und Unity als Standard-Desktop-Umgebung – ein willkommenes Upgrade vom alten GNOME 2.30, das mit Poseidon 4.0 geliefert wird.
Software-Highlights: Lab Plot, für interaktive Grafiken und Datenanalyse; QCAD, für 2D-Zeichnung; Blender für die 3D-Modellierung und QGIS, ein komplettes geografisches Informationssystem.
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Du kannst Poseidon Linux herunterladen kostenlos in der 32- und 64-Bit-Version.
Alternative: Wenn Sie nur Geografie- und Kartierungstools benötigen, versuchen Sie es OSGeo , ein auf Lubuntu basierendes Produkt der Open Source Geospatial Foundation.
3. CAElinux [Nicht mehr verfügbar]
Der Name ist der Schlüssel: CAE steht für Computer-Aided Engineering, und diese wissenschaftliche Distribution ist perfekt für jeden, der mit CAD, Modellierung, Prototyping, 3D-Druck und Physiksimulationen arbeitet. CAElinux wurde in der Schweiz entwickelt und basiert auf Xubuntu 12.04 und erfordert ein 64-Bit-System. Es bietet keine Desktop-Varianten außer Xfce, aber seine Softwareauswahl ist beeindruckend.
Software-Highlights: Salome, für 3D-CAD und Vernetzung; GMSH, für Geometriemodellierung; Scilab, für mathematische Programmierung; Paraview, für 3D-Visualisierung; ImageJ für die Bildverarbeitung und -analyse und Elmer für komplexe physikalische Modelle.
CAElinux ist als Live-DVD-Image kostenlos erhältlich oder Sie können eine physische Kopie zu einem erschwinglichen Preis bestellen.
Alternative: Wenn Sie nicht die ganze fortschrittliche Engineering-Software benötigen und nur einige 3D-Modellierungs- und Animationswerkzeuge benötigen, probieren Sie ArtistX aus, das wir ausführlich behandelt haben.
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Vier. Wissenschaftliches Linux
Nach all diesen *buntu-basierten Distributionen ist Scientific Linux ein echter Combo-Breaker: Es ist ein Rebuild von Red Hat Enterprise Linux. Die neueste Version (7.1, Codename Nitrogen) ist erst kürzlich in drei Varianten – KDE, GNOME und IceWM – nur für 64-Bit-Systeme erschienen. Aber nicht nur seine Basis zeichnet Scientific Linux aus. Im Gegensatz zu anderen Distributionen, die voller wissenschaftlicher Software sind, bietet Scientific Linux nur eine Grundausstattung an Apps. Was für eine hinterhältige, irreführende Distribution!
Nicht wirklich. Scientific Linux wird tatsächlich von Wissenschaftlern des Fermi National Accelerator Laboratory und der European Organization for Nuclear Research (CERN) entwickelt. Obwohl es standardmäßig nicht viele wissenschaftliche Anwendungen bietet, sind Dutzende in den Repositories leicht verfügbar. Mit Codecs und sofort einsatzbereiter Wireless-Unterstützung ist Scientific Linux eine gute Wahl für eine wissenschaftliche Umgebung, in der alles ohne viel Basteln funktioniert. Benutzer können nur die Software installieren, die sie benötigen, sodass ihr System nicht mit Apps überladen wird, die sie nie öffnen.
Software-Highlights: PostgreSQL und MySQL für Datenbanken und Anwendungsentwicklung; GNU Emacs-Texteditor; R-Programmiersprache; Frysk zur Systemanalyse und -überwachung und gnuplot zum Zeichnen mathematischer Ausdrücke. (Beachten Sie, dass einige dieser Apps nicht standardmäßig installiert werden, aber Sie können sie aus den Repositorys abrufen.)
Scientific Linux kann heruntergeladen werden als Live-DVD-Bild .
Alternative: Die Entwickler von Scientific Linux fördern die Erstellung von 'Spins' oder Builds basierend auf ihrem Projekt. Eine solche Distribution ist Fermi Linux ; eine gute, sicherheitsorientierte Option für diejenigen, die Scientific Linux auf einem 32-Bit-System ausführen möchten.
5. Fedora Scientific
Dieser Fedora-Spin stellt den Mittelweg zwischen einer hochspezialisierten und einer gewöhnlichen Linux-Distribution dar. Als solches ist es großartig für Forscher und Studenten aller wissenschaftlichen Hintergründe, obwohl es etwas zugunsten der numerisch-basierten Forschung tendiert. Die Standard-Desktop-Umgebung ist KDE, und Fedora Scientific ist sowohl für 32-Bit- als auch für 64-Bit-Architekturen verfügbar. Es wurde von Amit Saha mit Unterstützung von Fedora Science and Technology SIG entwickelt. Wunderschönen Online-Dokumentation stellt Ihnen Fedora Scientific vor und führt Sie durch die Softwareauswahl.
Software-Highlights: Maxima, eine komplette Algebra-Suite; LaTeX, zum Erstellen von Dokumenten und Präsentationen; Mayavi für die 3D-Datenvisualisierung und das Versionskontroll-Trifecta: git, Mercurial und Subversion.
Sie können die Fedora Scientific Live DVD entweder direkt herunterladen oder als Torrent herunterladen.
Alternative: Wenn Sie nach einer benutzerfreundlichen wissenschaftlichen Distribution suchen, die sich auf Mathematik konzentriert, ist Mathbuntu ein guter Ersatz für Fedora Scientific. Es ist als eigenständige Distribution oder als Paket für Ihre aktuelle Ubuntu-Installation erhältlich.
Unabhängig davon, für welches Wissenschaftsgebiet Sie sich interessieren, sollten Sie aus dieser Liste eine geeignete Distribution auswählen können. Nun zurück zu diesem Pop-Quiz – Was ist Ihre liebste wissenschaftliche Linux-Distribution? Können Sie andere ähnliche Distributionen nennen, die einen Platz in dieser Liste verdienen? Mach deine Hausaufgaben und teile deine Empfehlungen in den Kommentaren.
Bildnachweis: Ausgewähltes Bild , Nagios-basierte Überwachungswand im NOC über Flickr von Docklandsboy , Poseidon-Screenshot , CAElinux-Screenshot, Wissenschaftliches Linux über Wikimedia Commons , Screenshot von Fedora Scientific.
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Ivana Isadora ist freiberufliche Autorin und Übersetzerin, Linux-Liebhaberin und KDE-Fangirl. Sie unterstützt und fördert freie und Open-Source-Software und ist immer auf der Suche nach frischen, innovativen Apps. Finden Sie heraus, wie Sie mit uns in Kontakt treten können Hier .
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